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Siguiendo el camino marcado por SETI@HOME, del que se han cumplido dos años.
Varios proyectos científicos permiten una colaboración pública voluntaria gracias a Internet (pág.2).
Una decena de iniciativas de diversa índole, en las que se requiere una gran potencia de cálculo, han encontrado en la informática de proceso distribuido una solución a sus elevados requerimientos de computación.
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2. Biología molecular y bioingeniería.
Dependientes del Pande Group, con sede en el Departamento de Química de la Universidad de Stanford, existen varios proyectos que analizan diversas cuestiones relacionadas con la expresión génica y plegamiento de proteínas.
FOLDING@HOME (http://www.stanford.edu/group/pandegroup/Cosm/) analiza cómo se produce dicho plegamiento para dar lugar a la estructura terciaria proteica, de la que en última instancia depende su actividad funcional, en un enfoque similar al de algunos proyectos anteriormente comentados.
Gracias a una nueva técnica de simulación de plegamiento de proteínas bautizada como de "dinámica distribuida", se ha conseguido simular con éxito el plegamiento de diversos fragmentos proteicos y polímeros sintéticos proteicos. No obstante, su aplicación a proteínas reales, más complejas y de mayor tamaño, requiere la utilización de grandes cantidades de cálculo computacional, por lo que el equipo espera que la colaboración de numerosos usuarios pueda ayudar de forma importante en el proyecto.
 | El programa cliente de FOLDING@HOME en funcionamiento |
Su programa cliente es un salvapantallas que basa su funcionamiento en la suite de programas TINKER para diseño y modelado molecular desarrollada por el Laboratorio Jay Ponder del Dept. de Bioquímica y Biofísica Molecular de la Escuela de Medicina de Washington, en St. Louis, Missouri).
 | Hasta el momento presente, hay más de 17.000 usuarios de FOLDING@HOME. Existen versiones para Windows (95, 98, 2000, NT, ME), Linux (Intel) y Solaris (Sparc).
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Otro de los proyectos dependientes del Pande Group es GENOME@HOME (http://genomeathome.stanford.edu/). En él se busca el diseño de nuevos genes que puedan formar proteínas funcionales en la célula. El proyecto aborda pues los mismos interrogantes de FOLDING@HOME desde una perspectiva diferente: la construcción de esos "genomas virtuales", no existentes en la naturaleza que aumente nuestra comprensión de la expresión génica.
Para ello utiliza un algoritmo denominado Algoritmo de Predicción de Secuencia (Sequence Prediction Algorithm, o SPA), desarrollado por John Desjarlais en el Departamento de Química de la Universidad Estatal de Penn.
Las aplicaciones del proyecto podrían ser el diseño de nuevos fármacos y agentes terapéuticos, comprender la función de los nuevos genes secuenciados a diario y mejorar nuestra comprensión sobre la síntesis y evolución proteica.
 | Aproximadamente 20.000 usuarios han participado hasta la fecha en GENOME@HOME. |
Relacionado también con genómica, el Proyecto Folderol (http://www.folderol.org/) intenta suministrar una plataforma de código abierto para la exploración y análisis de los datos recopilados por el Proyecto Genoma Humano, en lo concerniente a plegamiento de proteínas derivadas de los genes analizados, búsqueda de las secuencias en el genoma humano, etc.
Se trata de un proyecto modesto si lo comparamos con los anteriores. La simulación actualmente en curso cuenta con la participación de más de 500 personas.
3. Biología evolutiva.
En el proyecto EVOLUTION@HOME (http://www.evolutionary-research.org/ y http://www.evolutionary-research.net/)
se persigue profundizar en el conocimiento de los factores que provocan la evolución de especies en la Tierra. Debido a la complejidad global del mismo se han diseñado varios subproyectos con diferentes simuladores, cada uno de los cuales buscará respuestas a una cuestión específica.
El primero de los planeados (Simulator005, ya existente) utiliza algoritmos basados en la teoría conocida como "trinquete de Muller" que trata sobre los factores genéticos, generalmente mutaciones nocivas, que influyen en la viabilidad de poblaciones de tamaño reducido.
(H. J. Muller, "The Relation of Recombination to Mutational Advance," Mutation Research 1 (1964): 2-9; and Domingo, et al., "Basic Concepts in RNA Virus Evolution," 859-64).
 | Actualmente, el simulador cliente utilizado en EVOLUTION@HOME es de tipo consola. La gestión del envío de resultados no está automatizada y estos deben enviarse por e-mail a una dirección destinada a tal efecto.
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Otro representante de la gran diversidad de iniciativas basadas en informática cooperativa de proceso distribuido es el proyecto GOLEM@HOME (Genetically Organized Lifelike Electro Mechanics, http://www.demo.cs.brandeis.edu/golem/), dentro del campo del estudio y diseño de formas de vida robóticas.
En él se realizan simulaciones de organismos artificiales mediante las que se que busca profundizar en la comprensión de los principios que rigen las formas biológicas reales.
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